Reconhecido pela excelência do seu ensino, o Sistema Acadêmico de Saúde FMUSP-HC conta com unidades voltadas à capacitação profissional em saúde, como o HCX (antiga Escola de Educação Permanente - EEP), além de desenvolver treinamentos especializados em diversos de seus institutos. Dessa forma, cumpre a sua missão de transmissão do conhecimento, de forma ética e inovadora, por meio das mais atuais metodologias de ensino e de avançadas tecnologias médicas.

Além de investirem na capacitação de profissionais da Rede de Atenção Básica à Saúde e no programa Estratégia de Saúde da Família, do Ministério da Saúde, os projetos firmados pela FFM também abrangem cursos de especialização docente, treinamentos em cirurgia remota, capacitação médica em transplantes, programa de formação profissional em pesquisa e inovação e atividades de tutoria em outros estados do País.

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